Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms