Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMURF2Q9HAU4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMURF2Q9HAU4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms