Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF1Q9H7N4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms