Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms