Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms