Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms