Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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