Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBF4Q9BQW3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EBF4Q9BQW3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms