Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNS3Q9BQ31 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms