Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RDH12Q96NR8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms