Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms