Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms