Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms