Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms