Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms