Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAF2Q96CS3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms