Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTSSAQ969W0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms