Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFKQ969G6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFKQ969G6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFKQ969G6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFKQ969G6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFKQ969G6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFKQ969G6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFKQ969G6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFKQ969G6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFKQ969G6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFKQ969G6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFKQ969G6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFKQ969G6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFKQ969G6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFKQ969G6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFKQ969G6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFKQ969G6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFKQ969G6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFKQ969G6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms