Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP13Q92995 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP13Q92995 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP13Q92995 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP13Q92995 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP13Q92995 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP13Q92995 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP13Q92995 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP13Q92995 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP13Q92995 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP13Q92995 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP13Q92995 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP13Q92995 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP13Q92995 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP13Q92995 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP13Q92995 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP13Q92995 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP13Q92995 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP13Q92995 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP13Q92995 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP13Q92995 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP13Q92995 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP13Q92995 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP13Q92995 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP13Q92995 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP13Q92995 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP13Q92995 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP13Q92995 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP13Q92995 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP13Q92995 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP13Q92995 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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