Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms