Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL2Q8NHH9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms