Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MYRIPQ8NFW9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms