Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF397Q8NF99 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms