Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms