Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC80Q76M96 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC80Q76M96 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC80Q76M96 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC80Q76M96 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC80Q76M96 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC80Q76M96 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC80Q76M96 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC80Q76M96 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC80Q76M96 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC80Q76M96 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC80Q76M96 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC80Q76M96 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC80Q76M96 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC80Q76M96 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC80Q76M96 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC80Q76M96 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC80Q76M96 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC80Q76M96 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms