Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPN12Q6ZSI9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms