Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR88Q6ZMY6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms