Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT6Q5T7P8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT6Q5T7P8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms