Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ANKRD39Q53RE8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms