Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RFTN2Q52LD8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms