Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETM2Q2VYF4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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