Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B3Q16720 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
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