Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms