Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNB3Q15768 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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