Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCF4Q15080 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NCF4Q15080 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCF4Q15080 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCF4Q15080 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCF4Q15080 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCF4Q15080 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCF4Q15080 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCF4Q15080 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCF4Q15080 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCF4Q15080 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCF4Q15080 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCF4Q15080 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCF4Q15080 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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