Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM2Q15035 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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