Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPA4Q13156 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms