Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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RAB40BQ12829 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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RAB40BQ12829 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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RAB40BQ12829 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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RAB40BQ12829 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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RAB40BQ12829 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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RAB40BQ12829 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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RAB40BQ12829 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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RAB40BQ12829 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
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