Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms