Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms