Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CREMQ03060 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CREMQ03060 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREMQ03060 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREMQ03060 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREMQ03060 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREMQ03060 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREMQ03060 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREMQ03060 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CREMQ03060 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREMQ03060 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREMQ03060 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREMQ03060 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREMQ03060 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CREMQ03060 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CREMQ03060 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CREMQ03060 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREMQ03060 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREMQ03060 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREMQ03060 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREMQ03060 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREMQ03060 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CREMQ03060 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREMQ03060 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREMQ03060 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREMQ03060 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CREMQ03060 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREMQ03060 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREMQ03060 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREMQ03060 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREMQ03060 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREMQ03060 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREMQ03060 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREMQ03060 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREMQ03060 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREMQ03060 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREMQ03060 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREMQ03060 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREMQ03060 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREMQ03060 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREMQ03060 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREMQ03060 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREMQ03060 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREMQ03060 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREMQ03060 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CREMQ03060 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREMQ03060 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREMQ03060 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CREMQ03060 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CREMQ03060 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms