Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MS4A2Q01362 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms