Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSG6Q00889 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms