Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGD1P98174 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGD1P98174 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms