Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM3AP98173 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms