Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX6P78412 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX6P78412 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IRX6P78412 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IRX6P78412 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX6P78412 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX6P78412 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX6P78412 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX6P78412 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX6P78412 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX6P78412 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX6P78412 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX6P78412 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX6P78412 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX6P78412 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX6P78412 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX6P78412 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX6P78412 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX6P78412 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX6P78412 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX6P78412 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX6P78412 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX6P78412 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX6P78412 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms