Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM193AP78312 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM193AP78312 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM193AP78312 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM193AP78312 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM193AP78312 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM193AP78312 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM193AP78312 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM193AP78312 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM193AP78312 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM193AP78312 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM193AP78312 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM193AP78312 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM193AP78312 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms