Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1-1P60608 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms