Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP12AP54707 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms