Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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PGGT1BP53609 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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PGGT1BP53609 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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